Model Pembelajaran Sekolah Auliya dirancang untuk mencapai Profil Pelajar Pancasila-Auliya melalui pendekatan Student Active Learning (SAL) dan High Order Thinking Skills (HOTS) yang dilaksanakan dalam suasana pembelajaran yang homy dan menyenangkan. Pendekatan SAL dan HOTS Auliya melatih siswa untuk meningkatkan kreativitasnya, kritis dalam menyikapi masalah dan mencari solusi, mampu bekerja sama dalam tim dan berkomunikasi dengan baik dalam bingkai nilai keislaman yang terintegrasi dalam setiap kegiatan.